方向是智慧与精神，因此她的伴生植物被称之为智慧之树，结出的卵也就是智慧之果。但实际上，智慧之树和生命之树都是同样的植物。

莉莉丝的降临导致地球受到了剧烈的冲击，引发了当时几乎立于生物链顶点的恐龙因此灭族，从而导致了亚当的第十五颗生命之果回收失败。同时，黑之月上的智慧之树的智慧因子洒向大地，催生了不以肉体力量取胜，而是靠着智慧立于食物链顶端的生命——人类，从某种意义上说，莉莉丝确实是这个世界所有人类的母亲没错了。【说起来亚当和莉莉丝的行为模式与最终幻想中的杰诺瓦细胞非常类似，只不过杰诺瓦细胞进行宇宙旅行是为了汲取星球的生命能量，亚当是为了获取更强的身体，而莉莉丝则是为了更强的智慧。】

亚当恼怒莉莉丝打乱了自己的计划，与莉莉丝进行了一场惊世大战，那场战斗可以说是天昏地暗，日月无光，战斗中，智慧树被毁灭，黑之月被打入地壳，生命之树重伤，树根化作朗基努斯枪。亚当能量殆尽，失去行动能力的他只好等待使徒从生命之果中觉醒，完成补全从而乘坐月球离开，再次开始循环，而莉莉丝则同样重伤频死，下半身被蒸发。而这一次战斗，史称——第一次冲击。

由于智慧之树被毁，莉莉丝无力回收智慧之果，在无奈之下将自己的生命因子和已经结成的生命之果进行置换（也就是想要将这些使徒体内的亚当细胞转化成自己的细胞，同时也将生命之果中的一部分生命因子同化，这样才能够让自己和生命之果拥有联系，从而在将来获得这份肉*体【这也是后来为什么使徒会把莉莉丝当成亚当的原因】，这个过程要持续千百万年，直到同化结束生命之果才能孵化），并存放于世界各地，自身则进入冰层沉睡，一边养伤一边等待生命之果孵化，企图东山再起。

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